两所都是重点大学，但，华中科技大学的总体实力更强和名气更大。
教育部学科专业排名如下：
华中科技大学
最好的一级学科专业共十五个：
工科专业－－－：机械工程全国第二、电气工程全国第三、控制科学与工程全国第五、生物医学工程全国第五、光学工程全国第六、动力工程及工程热物理全国第六、计算机科学与技术全国第九、电子科学与技术全国第九。
医科专业－－－：公共卫生与预防医学全国第二、基础医学全国第五、中西医结合全国第五、临床医学全国第六。
管理学类专业－：公共管理全国第四。
人文社科类专业：新闻传播学全国的七、教育学全国第十。
较好的一级学科专业共十一个：
工科专业－－－：信息与通信工程全国第12、材料科学与工程全国13、土木工程全国17。
理科专业－－－：力学全国第16、数学全国第19、物理学全国第19。
管理学类专业－：管理科学与工程全国第13、工商管理全国第16。
经济学类专业－：理论经济学全国第14。
人文社科类专业：社会学全国第12、法学全国第19。
东南大学
最好的一级学科专业共十一个：
工科专业－－－：生物医学工程全国第一、交通运输与工程全国第二、建筑学全国第三、土木工程全国第五、电子科学与技术全国第六、仪器科学与技术全国第七、信息与通信工程全国第八、动力工程与工程热物理全国第十、电气工程全国第十。
医科专业－－－：公共卫生与预防医学全国第九。
人文社科类专业：艺术学全国第三。
较好的一级学科专业共九个：
工科专业－－－：控制科学与工程全国第14、计算机科学与技术全国第14、化学工程与技术全国第20。
医科专业－－－：临床医学全国第20。
理科专业－－－：数学全国全国第13。
管理学类专业－：管理科学与工程全国第15。
经济学类专业－：应用经济学全国全国第18。
人文社科类专业：教育学全国全国第14、哲学全国全国第17。
教育部学科专业排名如下：
华中科技大学
最好的一级学科专业共十五个：
工科专业－－－：机械工程全国第二、电气工程全国第三、控制科学与工程全国第五、生物医学工程全国第五、光学工程全国第六、动力工程及工程热物理全国第六、计算机科学与技术全国第九、电子科学与技术全国第九。
医科专业－－－：公共卫生与预防医学全国第二、基础医学全国第五、中西医结合全国第五、临床医学全国第六。
管理学类专业－：公共管理全国第四。
人文社科类专业：新闻传播学全国的七、教育学全国第十。
较好的一级学科专业共十一个：
工科专业－－－：信息与通信工程全国第12、材料科学与工程全国13、土木工程全国17。
理科专业－－－：力学全国第16、数学全国第19、物理学全国第19。
管理学类专业－：管理科学与工程全国第13、工商管理全国第16。
经济学类专业－：理论经济学全国第14。
人文社科类专业：社会学全国第12、法学全国第19。
东南大学
最好的一级学科专业共十一个：
工科专业－－－：生物医学工程全国第一、交通运输与工程全国第二、建筑学全国第三、土木工程全国第五、电子科学与技术全国第六、仪器科学与技术全国第七、信息与通信工程全国第八、动力工程与工程热物理全国第十、电气工程全国第十。
医科专业－－－：公共卫生与预防医学全国第九。
人文社科类专业：艺术学全国第三。
较好的一级学科专业共九个：
工科专业－－－：控制科学与工程全国第14、计算机科学与技术全国第14、化学工程与技术全国第20。
医科专业－－－：临床医学全国第20。
理科专业－－－：数学全国全国第13。
管理学类专业－：管理科学与工程全国第15。
经济学类专业－：应用经济学全国全国第18。
人文社科类专业：教育学全国全国第14、哲学全国全国第17。
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第1个回答 2009-06-25
我是东南大学的，我们学校的本科教育还是不错的，抓得比较严，不过要不同学院也不一样，总的还是不错。
第2个回答 2009-06-25
专业不同 各有千秋 不过南京挺不错的
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