没有影响，灵活就业协议只是统计学生就业情况，做给上级领导看的，很多数据是不真实的，并没有法律效力，所以并不会影响应届生身份。
一般来说，只有国企、事业单位、行政单位等才需要调档案，其他人员档案一般都是直接放在人才市场。如果毕业两年内未落实工作，可以按照应届身份报考。如果在私企工作，档案在人才市场，报到证抬头也是XX人社局，能比较容易和单位正常解约，一般来说也可以按照应届身份报考。
扩展资料
高校毕业生灵活就业包括以下2种类型：
(1)自主创业，指创立企业(包括参与创立企业)，或是新企业的所有者、管理者，包括个体经营和合伙经营两种类型。
(2)自由职业，指以个体劳动为主的一类职业，如作家、自由撰稿人、翻译工作者、中介服务工作者、某些艺术工作者等。
2004年教育部为落实国家要求，在《关于进一步加强和完善高校毕业生就业状况统计报告工作的通知》中提出将灵活就业纳入毕业生就业统计范畴，扩大了就业统计的范畴。
学校要求签订灵活就业协议对于学生本人是没有太大影响的，因为灵活就业是老师为了完成学生整体的就业率所商量的协议。
如果以后不想要继续向更高程度的学历努力奋斗，那么就可以签订这个协议。如果没有打算去工作，而是想要继续上学，那么就不建议签订这份协议。
一旦协议签订之后，学生就要去自主择业，人们就没有办法获得当地国家政府的就业计划安排，已经被视同就业了。当地的人事部门也不会专门发介绍信让你到新单位工作，多适用于自主创业的学生。
就业数据
现在每个学校每年毕业生的就业率都是要经过国家政府部门的统计的，如果统计的数量不符合要求，或者没有达到大部分学校的招生就业水平，那么学校可能要承担很大的压力。灵活就业协议其实就是为了让学校应付就业压力的一个协议，并且辅导员也可以因为自己学生就业率提高从而让自己的业绩大幅度提高，辅导员也是在这个协议当中最受利的群体。
以上内容参考：凤凰网-文科毕业生就业：近4成灵活就业 哲学专业最难就业
本回答被网友采纳灵活就业协议肯定会放入档案，但不影响你考研，也没有其它方面的影响。
因为即使你工作了，签订了劳动合同，一样可以按劳动法的规定辞职考研，何况你只是灵活就业人员。
关于灵活就业和应届生毕业涉及到的那些合同，可以通过一张图进行了解。
